Şehzade Yakup Bey kazanılan I. Kosova Zaferi'nin hemen akabinde ordusunun başında düşman artıklarını takipten geliyordu.
Babasının az önceki ölümünden, Bayezid'in onun yerini alacağından tamamen habersizdi. Kumandanlar Sultan Birinci Murad'ın vasiyetine uyarak Yıldırım Bayezid'in tahta çıkmasını, fakat taht kavgasının önlenmesi için Yakup Çelebi'nin öldürülmesini uygun buldular.
Bayezid kadar sevilen ve büyük bir ordunun başında bulunan Yakup Çelebi ile Yıldırım Bayezid arasında taht kavgası olursa, kazanılan zafer boşa gidecek, belki de bundan sonra Balkanlar'da tutunmak mümkün olamayacaktı. Onun için, babasıyla görüşmek için Otağ-ı Humayün'a giren Yakup Çelebi, Yıldırım Bayezid'in onayı ile oracıkta öldürüldü.
Cenazesi babasının cenazesi ile birlikte Bursa'ya götürüldü.
